La organización ha gestado una serie de esfuerzos orientados a amalgamar un Sistema Organizacional de Gestión de Proyectos que haga coexistir elementos como: el estado del arte en la literatura y casos de éxitos de gestión de proyectos a nivel mundial, el marco normativo de la inversión pública, y los retos que conlleva el quehacer institucional de una institución operadora de la mayoría de sistemas de agua potable y saneamiento del país. En términos de prácticas innovadoras gestión de proyectos de inversión, la organización ha venido destacando en la institucionalidad pública en el país, gracias a la maduración de un proceso que aún está en marcha pero que ha dado sus frutos. Los elementos que componen este sistema han venido siendo orquestados por la Oficina de Gestión de Proyectos e incluyen: metodologías de gestión de proyectos y portafolios, directrices, capacitaciones, sistemas de información, los cuales han sentado las bases de una cultura innovadora de gestión de proyectos.